ООПТ России

Рельеф заказника равнинный с небольшими повышениями и понижениями в окрестностях водоемов. На территории заказника развита гидрологическия сеть. В южной части расположено озеро Красный окунь площадью около 20 км2. Дно озера покрыто большим количеством сапропеля. Берега озера сильно заболочены. В заказнике протекает большое количество мелких рек и ручьев. Самой крупной речкой, вытекающей из озера, является Явроньга. Ее ширина не более 10 м, берега сильно заболочены. Кроме Явроньги имеются небольшие речки: Черная, Квалова (притоки Явроньги), Шукшамена, Ниж. Сорова, В. Нема.
Растительность представлена, в основном лесными сообществами: ельниками сфагновыми черничными, брусничными, разнотравными (преобладают), небольшими по площади сосновыми (сосняки лишайниковые и др.) лесами. Часть лесов была вырублена, часть выгорела в результате пожаров естественного происхождения. В ближних окрестностях оз. Красный окунь, вдоль старой монастырской дороги произрастают вторичные лиственные леса и заросли кустарников (ивы, серая ольха, черемуха и др.). Верховые сфагновые, пушициево-сфагновые и кустарничково-сфагновые болота располагаются большей частью по берегам озера Красный окунь. В окрестностях скита имеются небольшие по площади вторичные разнотравно-злаковые луга.
В Монастырском государственном природном биологическом заказнике регионального значения обитают 4 видов земноводных, 1 вида пресмыкающихся, 80 видов птиц и 32 видов млекопитающих. Десять видов животных относятся к категории редких и уязвимых видов. Четыре вида включены в Красную книгу России: пискулька, скопа, орлан-белохвост и филин. Кроме перечисленных еще 4 вида включены в Красную книгу Архангельской области: лебедь-кликун, мохноногий сыч, длиннохвостая и бородатая неясыти, 2 вида внесены в список видов для бионадзора: сибирский углозуб и серый журавль. Кроме того, на территории Монастырского заказника нами были обнаружены два редко встречающихся на территории области вида птиц: обыкновенный турпан и большой веретенник.
В еловых лесах в заказнике доминируют буроголовая гаичка, снегирь, пестрый дятел, теньковка, деряба, обыкновенная чечетка, клесты, обыкновенная белка и др. Обычны бурундук, заяц-беляк и др.
В сосняках наблюдается высокое обилие сероголовой гаички, клестов, довольно обычна кукша и свиристель. Здесь встречаются живородящие ящерицы, зяблик, вьюрок, теньковка, зарянка и др.
Вторичные лиственные леса и их опушки предпочитают оба вида лягушек, черныш, вальдшнеп, рябчик и тетерев, пестрый дятел, об. кукушка, зяблик, вьюрок, пеночка-весничка, рябинник и белобровик, чиж и обыкновенная чечевица.
Верховые болота заселены живородящей ящерицей, травяной лягушкой. Из птиц здесь обычны кулики (большой и средний кроншнепы, фифи, большой улит), белая куропатка, желтая трясогузка, лесной конек. Из млекопитающих верховые болота посещают лось, горностай, обыкновенная лисица, волк и др.
Берега водоемов заселяют утки (хохлатая чернеть, чирок-свистунок, гоголь и др.), кулики, сизая чайка, тростниковая овсянка, камышевка-барсучок. Из млекопитающих здесь обитают ондатра, речной бобр, норки, выдры и другие виды.
Небольшие по площади луговины заселяются лягушками, живородящими ящерицами, трясогузками, серыми славками, луговыми чеканами, тростниковыми овсянками и др. Их посещают горностай и ласка, заяц-беляк и др. Здесь обычен обыкновенный крот.