| Lycopodiophyta (Плауновые) |
| Isoetopsida (Полушниковые) |
| Isoetales (Полушниковые) |
| Isoetaceae (Полушниковые) |
| 1 | Isoetes lacustris | Полушник озерный | | 2 (V) | Isoetes lacustris |
| Magnoliophyta (Покрытосеменные) |
| Monocots (Однодольные) |
| Alismatales (Частуховые) |
| Hydrocharitaceae (Водокрасовые) |
| 1 | Hydrilla verticillata | Гидрилла мутовчатая | | 2 (V) | Hydrilla verticillata |
| Asparagales (Спаржевые) |
| Amaryllidaceae (Амариллисовые) |
| 1 | Allium altaicum | Лук алтайский (мелколуковичный, дикий батун) | | 3 (R) | Allium altaicum |
| 2 | Allium eduardii | Лук Эдуарда | | 3 (R) | Allium eduardii |
| 3 | Allium pumilum | Лук низкий | | 3 (R) | Allium pumilum |
| 4 | Allium tytthocephalum | Лук мелкоголовый | | 2 (V) | Allium tytthocephalum |
| 5 | Allium tulipifolium | Лук тюльпанолистный | | 3 (R) | Allium tulipifolium |
| 6 | Allium ubsicolum | Лук убсунурский | | 3 (R) | Allium ubsicolum |
| Iridaceae (Ирисовые) |
| 1 | Iris tigridia | Касатик тигровый | | 2 (V) | Iris tigridia |
| Orchidaceae (Орхидные) |
| 1 | Cypripedium calceolus | Башмачок настоящий, Венерин башмачок | | 2 (V) | Cypripedium calceolus |
| 2 | Cypripedium macranthon | Венерин башмачок крупноцветковый | | 2 (V) | Cypripedium macranthos |
| 3 | Cypripedium guttatum | Башмачок капельный, башмачок крапчатый | | 2 (V) | Cypripedium guttatum |
| 4 | Dactylorhiza baltica | Пальцекорник балтийский | | 3 (R) | Dactylorhiza baltica |
| 5 | Dactylorhiza fuchsia | Пальцекорник Фукса | | 3 (R) | Dactylorhiza fuchsii |
| 6 | Orchis militaris | Ятрышник шлемоносный, Ятрышник вооруженный | | 3 (R) | Orchis militaris |
| 7 | Epipactis helleborine | Дремлик широколистный, Дремлик лесной | | 2 (V) | Epipactis helleborine |
| 8 | Epipactis palustris | Дремлик болотный | | 2 (V) | Epipactis palustris |
| 9 | Epipogium aphyllum | Надбородник безлистный | | 3 (R) | Epipogium aphyllum |
| 10 | Neottianthe cucullata | Неоттианте клобучковая, Гнездоцветка клобучковая | | 3 (R) | Neottianthe cucullata |
| 11 | Platanthera bifolia | Любка двулистная | | 3 (R) | Platanthera bifolia |
| 12 | Tulotis fuscescens | Тулотис буреющий | | 2 (V) | Platanthera fuscescens |
| Liliales (Лилейные) |
| Liliaceae (Лилейные) |
| 1 | Erytronium sibiricum | Кандык сибирский | | 3 (R) | Erythronium sibiricum |
| 2 | Fritillaria meleagris | Рябчик шахматный | | 2 (V) | Fritillaria meleagris |
| 3 | Fritillaria verticillata | Рябчик мутовчатый | | 3 (R) | Fritillaria verticillata |
| 4 | Gagea altaica | Гусиный лук алтайский | | 3 (R) | Gagea altaica |
| 5 | Gagea granulosa | Гусиный лук зернистый (Гусятник) | | 3 (R) | Gagea granulosa |
| 6 | Tulipa uniflora | Тюльпан одноцветковый | | 2 (V) | Tulipa uniflora |
| Poales (Злаки) |
| Poaceae (Злаки) |
| 1 | Stipa pennata | Ковыль перистый | | 3 (R) | Stipa pennata |
| 2 | Stipa consanguinea | Ковыль родственный | | 3 (R) | Stipa consanguinea |
| 3 | Festuca altissima | Овсяница высокая | | 3 (R) | Festuca altissima |
| 4 | Brachypodium sylvaticum | Коротконожка лесная | | 3 (R) | Brachypodium sylvaticum |
| Eudicots (Настоящие двудольные) |
| Apiales (Зонтичные) |
| Apiaceae (Зонтичные) |
| 1 | Sanicula giraldii | Подлесник Жиральда | | 2 (V) | Sanicula giraldii |
| 2 | Osmorhiza aristata | Осмориза остистая | | 3 (R) | Osmorhiza aristata |
| 3 | Bupleurum martjanovii | Володушка Мартьянова | | 3 (R) | Bupleurum martjanovii |
| Asterales (Сложноцветные) |
| Asteraceae (Сложноцветные) |
| 1 | Arnica iljinii | Арника Ильина | | 2 (V) | Arnica angustifolia subsp. iljinii |
| 2 | Brachanthemum baranovii | Брахантемум Баранова | | 2 (V) | Brachanthemum baranovii |
| 3 | Brachanthemum krylovianum | Брахантемум Крылова | | 2 (V) | Brachanthemum krylovianum |
| 4 | Dendranthema sinuatum | Дендрантема выемчатолистная | | 2 (V) | Chrysanthemum sinuatum |
| 5 | Stemmacantha carthamoides | Маралий корень сафлоровидный | | 3 (R) | Rhaponticum carthamoides |
| 6 | Saussurea glacialis | Соссюрея ледниковая (Горькуша) | | 3 (R) | Saussurea glacialis |
| 7 | Saussurea jadrinzevii | Соссюрея Ядринцева | | 1 (E) | Saussurea jadrinzevii |
| 8 | Saussurea orgaadayi | Соссюрея оргаадай (Горькуша) | | 2 (V) | Saussurea orgaadayi |
| 9 | Saussurea serratuloides | Соссюрея серпуховидная | | 3 (R) | Saussurea serratuloides |
| 10 | Rhinanctinidia eremophila | Крыловия пустынностепная | | 3 (R) | Rhinactinidia eremophila |
| Campanulaceae (Колокольчиковые) |
| 1 | Campanula trachelium | Колокольчик крапиволистный | | 3 (R) | Campanula trachelium |
| Caryophyllales (Гвоздичные) |
| Amaranthaceae (Ширицевые) |
| 1 | Corispermum altaicum | Верблюдка алтайская | | 1 (Е) | Corispermum altaicum |
| 2 | Corispermum mongolicum | Верблюдка монгольская | | 3 (R) | Corispermum mongolicum |
| 3 | Chenopodium frutescens | Марь кустарниковая | | 2 (V) | Chenopodium frutescens |
| Caryophyllaceae (Гвоздичные) |
| 1 | Mesostemma martjanovii | Мезостемма Мартьянова | | 3 (R) | Mesostemma martjanovii |
| Polygonaceae (Гречишные) |
| 1 | Rheum altaicum | Ревень алтайский | | 3 (R) | Rheum compactum |
| Fabales (Бобовые) |
| Fabaceae (Бобовые) |
| 1 | Astragalus aksaicus | Астрагал аксайский | | 2 (V) | Astragalus aksaicus |
| 2 | Astragalus argutensis | Астрагал аргутский | | 3 (R) | Astragalus argutensis |
| 3 | Astragalus tschuensis | Астрагал чуйский | | 3 (R) | Astragalus tschujensis |
| 4 | Astragalus brachybotrys | Астрагал коротколопастной | | 3 (R) | Astragalus brachybotrys |
| 5 | Astragalus luxurians | Астрагал роскошный | | 1 (E) | Astragalus luxurians |
| 6 | Astragalus leptostachys | Астрагал длиннокрылый | | 3 (R) | Astragalus sulcatus |
| 7 | Astragalus macroceras | Астрагал крупнорогий | | 3 (R) | Astragalus macroceras |
| 8 | Astragalus politovii | Астрагал Политова | | 3 (R) | Astragalus politovii |
| 9 | Astragalus pseudoaustralis | Астрагал ложноюжный | | 3 (R) | Astragalus pseudoaustralis |
| 10 | Astragalus puberulus | Астрагал пушистый | | 3 (R) | Astragalus puberulus |
| 11 | Astragalus rytidocarpus | Астрагал морщинистоплодный | | 3 (R) | Astragalus rytidocarpus |
| 12 | Astragalus tephrolobus | Астрагал круглоплодный | | 2 (V) | Astragalus tephrolobus |
| 13 | Glycyrrhiza uralensis | Солодка уральская | | 2 (V) | Glycyrrhiza uralensis |
| 14 | Gueldenstaedtia monophylla | Гюльденштедтия однолистная | | 2 (V) | Gueldenstaedtia monophylla |
| 15 | Caragana jubata | Карагана гривастая | | 3 (R) | Caragana jubata |
| 16 | Hedysarum theinum | Копеечник чайный (красный корень) | | 2 (V) | Hedysarum theinum |
| 17 | Oxytropis acanthacea | Остролодочник колючий | | 3 (R) | Oxytropis acanthacea |
| 18 | Oxytropis alpestris | Остролодочник приальпийский | | 3 (R) | Oxytropis alpestris |
| 19 | Oxytropis ampullata | Остролодочник пузырчатый | | 3 (R) | Oxytropis ampullata |
| 20 | Oxytropis confusa | Остролодочник смешиваемый | | 3 (R) | Oxytropis confusa |
| 21 | Oxytropis kaspensis | Остролодочник каспийский | | 3 (R) | Oxytropis kaspensis |
| 22 | Oxytropis ladyginii | Остролодочник Ладыгина | | 3 (R) | Oxytropis ladyginii |
| 23 | Oxytropis martjanovii | Остролодочник Мартьянова | | 3 (R) | Oxytropis martjanovii |
| 24 | Oxytropis nivea | Остролодочник белоснежный | | 3 (R) | Oxytropis nivea |
| 25 | Oxytropis saposchnikovii | Остролодочник Сапожникова | | 3 (R) | Oxytropis saposhnikovii |
| 26 | Oxytropis stenophylla | Остролодочник остролистный | | 2 (V) | Oxytropis stenophylla |
| 27 | Oxytropis trichophysa | Остролодочник пушистопузырчатый | | 3 (R) | Oxytropis trichophysa |
| Gentianales (Горечавковые) |
| Rubiaceae (Мареновые) |
| 1 | Galium paradoxum | Подмаренник удивительный | | 3 (R) | Galium paradoxum |
| 2 | Galium triflorum | Подмаренник трехцветковый | | 3 (R) | Galium triflorum |
| Geraniales (Гераниевые) |
| Geraniaceae (Гераниевые) |
| 1 | Geranium robertianum | Герань Роберта | | 3 (R) | Geranium robertianum |
| Lamiales (Губоцветые) |
| Orobanchaceae (Заразиховые) |
| 1 | Pedicularis longiflora | Мытник длинноцветковый | | 2 (V) | Pedicularis longiflora |
| Myrtales (Миртовые) |
| Lythraceae (Дербенниковые) |
| 1 | Trapa natans | Водяной орех плавающий, Рогульник плавающий | | 1 (Е) | Trapa natans |
| Rosales (Розоцветные) |
| Rosaceae (Розоцветные) |
| 1 | Sanguisorba azovtsevii | Кровохлебка Азовцева | | 3 (R) | Sanguisorba azovtsevii |
| 2 | Potentilla kryloviana | Лапчатка Крылова | | 3 (R) | Potentilla kryloviana |
| 3 | Sibiraea altaiensis | Сибирка алтайская | | 2 (V) | Sibiraea laevigata |
| Santalales (Санталовые) |
| Santalaceae (Санталовые) |
| 1 | Thesium rupestre | Ленец каменистый | | 2 (V) | Thesium rupestre |
| Saxifragales (Камнеломковые) |
| Paeoniaceae (Пионовые) |
| 1 | Paeonia hybrida | Пион степной или гибридный | | 3 (R) | Paeonia tenuifolia |
| Crassulaceae (Толстянковые) |
| 1 | Rhodiola algida | Родиола холодная | | 3 (R) | Rhodiola algida |
| 2 | Rhodiola rosea | Родиола розовая | | 2 (V) | Rhodiola rosea |
| 3 | Rhodiola quadrifida | Родиола четырехчленная | | 2 (V) | Sedum quadrifidum |
| 4 | Rhodiola krylovii | Родиола почтиперистая | | 2 (V) | Rhodiola krylovii |
| 5 | Rhodiola coccinea | Родиола ярко-красная | | 2 (V) | Rhodiola coccinea |
| Saxifragaceae (Камнеломковые) |
| 1 | Chrysosplenium filipes | Селезеночник нитевидный | | 2 (V) | Chrysosplenium filipes |
| unplaced in an order (не включены в какой-либо порядок) |
| Boraginaceae (Бурачниковые) |
| 1 | Mertensia pallasii | Мертензия Палласа | | 2 (V) | Mertensia pallasii |
| 2 | Craniospermum subfloccosum | Черепосемянник хлопьевидно-шерстистый | | 3 (R) | Craniospermum subfloccosum |
| Brassicales |
| Brassicaceae (Крестоцветные) |
| 1 | Aphragmus involucratus | Одногнездка обернутая | | 3 (R) | Aphragmus involucratus |
| 2 | Dentaria sibirica | Зубянка сибирская | | 2 (V) | Cardamine altaica |
| 3 | Subularia aquatica | Шильник водный | | 2 (V) | Subularia aquatica |
| Malpighiales |
| Euphorbiaceae (Молочаевые) |
| 1 | Euphorbia rupestris | Молочай скальный | | 2 (V) | Euphorbia rupestris |
| 2 | Euphorbia macrorhiza | Молочай длиннокорневой | | 3 (R) | Euphorbia macrorhiza |
| Linaceae (Льновые) |
| 1 | Linum violascens | Лен фиолетовый | | 2 (V) | Linum violascens |
| Violaceae (Фиалковые) |
| 1 | Viola incisa | Фиалка надрезанная | | 2 (V) | Viola incisa |
| Malvales |
| Thymelaeaceae (Тимелеевые) |
| 1 | Stelleropsis altaica | Стеллеропсис алтайский | | 3 (R) | Diarthron altaica |
| 2 | Daphne altaica | Волчник алтайский | | 2 (V) | Daphne altaica |
| 3 | Daphne mezereum | Волчник обыкновенный, волчье лыко, Волчеягодник обыкновенный | | 3 (R) | Daphne mezereum |
| Ranunculales |
| Berberidaceae (Барабарисовые) |
| 1 | Gymnospermum altaicum | Голосемянник алтайский | | 3 (R) | Gymnospermium altaicum |
| Ranunculaceae (Лютиковые) |
| 1 | Aconitum decipiens | Борец неприметный (ненайденный) | | 3 (R) | Aconitum decipiens |
| 2 | Aconitum biflorum | Борец двухцветковый | | 3 (R) | Aconitum biflorum |
| 3 | Aconitum paskoi | Борец Паско | | 3 (R) | Aconitum paskoi |
| 4 | Actaea spicata | Воронец колосовидный | | 3 (R) | Actaea spicata |
| 5 | Adonis vernalis | Горицвет весенний, Желтоцвет весенний, Адонис весенний | | 3 (R) | Adonis vernalis |
| 6 | Adonis villosa | Адонис пушистый (Стародубка, Горицвет) | | 3 (R) | Adonis villosa |
| 7 | Delphinium ukokense | Живокость укокская | | 3 (R) | Delphinium ukokense |
| Menispermaceae |
| 1 | Menispermum dauricum | Луносемянник даурский | | 1 (Е) | Menispermum dauricum |
| Zygophyllales |
| Zygophyllaceae (Парнолистниковые) |
| 1 | Zygophyllum pinnatum | Парнолистник перистый (крупнокрылый) | | 2 (V) | Zygophyllum pinnatum |
| Magnoliids (Магнолиды) |
| Piperales |
| Aristolochiaceae (Кирказоновые) |
| 1 | Asarum europaeum | Копытень европейский | | 3 (R) | Asarum europaeum |
| Pteridophyta (Папоротники) |
| Psilotopsida (Псилотовидные) |
| Ophioglossales (Ужовниковые) |
| Ophioglossaceae (Ужовниковые) |
| 1 | Ophioglossum vulgatum | Ужовник обыкновенный | | 3 (R) | Ophioglossum vulgatum |
| 1 | Botrychium multifidum | Гроздовник многораздельный | | 3 (R) | Botrychium multifidum |
| 2 | Botrychium virginianum | Гроздовник вирджинский | | 3 (R) | Botrychium virginianum |
| Pteridopsida (Папоротниковые) |
| Polypodiales (Многоножковые) |
| Aspleniaceae (Костенцовые) |
| 1 | Asplenium altajense | Костенец алтайский | | 1 (Е) | Asplenium scolopendrium |
| 2 | Asplenium trichomanes | Костенец волосовидный | | 2 (V) | Asplenium trichomanes |
| 3 | Asplenium exiguum | Костенец скудный | | 1 (Е) | Asplenium exiguum |
| Dryopteridaceae (Щитовниковые) |
| 1 | Dryopteris cristata | Щитовник гребенчатый | | 1 (E) | Dryopteris cristata |
| Polypodiaceae (Многоножковые) |
| 1 | Lepisorus clathratus | Лепизорус обрешеченный, чешуекучник, многоножка линейная | | 1 (Е) | Lepisorus clathratus |
Все ООПТ
