| Actinopterygii (Костистые рыбы) |
| Acipenseriformes (Осетрообразные) |
| Acipenseridae (Осетровые) |
| 2 | Acipenser ruthenus | Стерлядь | Ангарская популяция - р. Тасеева; Обская популяция - р. Чулым | 3 | Acipenser ruthenus |
| 3 | Acipenser baerii | Сибирский осетр | Популяция бассейна Оби, субпопуляция бассейна р. Пясины | 2 | Acipenser baerii |
| Salmoniformes (Лососеобразные) |
| Salmonidae (Лососевые) |
| 1 | Prosopium cylindraceum | Обыкновенный валек | Южная субпопуляция - р. Туба | 3 | Prosopium cylindraceum |
| 4 | Brachymystax lenok | Ленок | Популяция бассейна Оби | 1 | Brachymystax lenok |
| Amphibia (Амфибии) |
| Anura (Бесхвостые) |
| Ranidae (Лягушки) |
| 2 | Rana ridibunda | Озерная лягушка | | 4 | Pelophylax ridibundus |
| 3 | Rana amurensis | Сибирская лягушка | | 3 | Rana amurensis |
| Caudata |
| Salamandridae (Саламандровые) |
| 1 | Triturus vulgaris | Обыкновенный тритон | | 4 | Lissotriton vulgaris |
| Aves (Птицы) |
| Anseriformes (Гусеобразные) |
| Anatidae (Утиные) |
| 9 | Branta nigricans | Американская (тихоокеанская черная) казарка | | 4 | Branta nigricans |
| 10 | Rufibrenta ruficollis | Краснозобая казарка | | 3 | Branta ruficollis |
| 11 | Anser anser | Серый гусь | | 2 | Anser anser |
| 12 | Anser erythropus | Пискулька | | 2 | Anser erythropus |
| 13 | Anser fabalis rossicus | | Тувино-минусинская субпопуляция; Красноярско-канская субпопуляция | 2 | Anser fabalis rossicus |
| 14 | Anser fabalis middendorffii | Таёжный гуменник | Саянская субпопуляция; Ангаро-тунгусская субпопуляция; Эвенкийская и мойеро-котуйская субпопуляция | 2; 3; 4 | Anser fabalis middendorffii |
| 15 | Eulabeia indica | Горный гусь | | 4 | Anser indicus |
| 16 | Cygnopsis cygnoides | Сухонос | | 7 | Anser cygnoides |
| 17 | Cygnus cygnus | Лебедь-кликун | Саяно-минусинская субпопуляция; Ангарская субпопуляция; Обь-енисейская субпопуляция; Енисейско-тазовская субпопуляция; Эвенкийская субпопуляция | 4; 4; 4; 3; 4 | Cygnus cygnus |
| 18 | Cygnus bewickii | Малый лебедь | Гыданская и Таймырская субпопуляции | 5 | Cygnus columbianus bewickii |
| 19 | Tadorna tadorna | Пеганка | | 3 | Tadorna tadorna |
| 20 | Anas formosa | Клоктун | | 4 | Anas formosa |
| 21 | Anas falcata | Касатка | | 4 | Anas falcata |
| Apodiformes (Стрижеобразные) |
| Apodidae (Стрижи) |
| 78 | Hirundapus caudacutus | Иглохвостый стриж | | 4 | Hirundapus caudacutus |
| Charadriiformes (Ржанкообразные) |
| Haematopodidae (Кулики-сороки) |
| 51 | Haematopus ostralegus | Кулик-сорока | | 4 | Haematopus ostralegus |
| Laridae (Чайковые) |
| 67 | Larus ichthyaetus | Черноголовый хохотун | | 7 | Ichthyaetus ichthyaetus |
| 68 | Larus minutus | Малая чайка | | 4 | Hydrocoloeus minutus |
| 69 | Rhodostethia rosea | Розовая чайка | | 3 | Rhodostethia rosea |
| 70 | Pagophila eburnea | Белая чайка | | 3 | Pagophila eburnea |
| 71 | Chlidonias leucopterus | Белокрылая крачка | | 4 | Chlidonias leucopterus |
| 72 | Chlidonias niger | Черная крачка | | 4 | Chlidonias niger |
| 73 | Hydroprogne caspia | Чеграва | | 7 | Hydroprogne caspia |
| Charadriidae (Ржанковые) |
| 47 | Charadrius alexandrinus | Морской зуек | | 3 | Charadrius alexandrinus |
| 48 | Eudromias morinellus | Хрустан | | 4 | Charadrius morinellus |
| Recurvirostridae (Шилоклювковые) |
| 49 | Himantopus himantopus | Ходулочник | | 7 | Himantopus himantopus |
| 50 | Recurvirostra avosetta | Шилоклювка | | 3 | Recurvirostra avosetta |
| Scolopacidae (Бекасовые) |
| 52 | Heteroscelus brevipes | Сибирский пепельный улит | | 4 | Tringa brevipes |
| 53 | Calidris ruficollis | Песочник-красношейка | | 3 | Calidris ruficollis |
| 54 | Calidris subminuta | Длиннопалый песочник | | 4 | Calidris subminuta |
| 55 | Calidris maritima | Морской песочник | | 3 | Calidris maritima |
| 56 | Calidris acuminata | Острохвостый песочник | | 4 | Calidris acuminata |
| 57 | Calidris canutus | Исландский песочник | | 4 | Calidris canutus |
| 58 | Calidris alba | Песчанка | | 3 | Calidris alba |
| 59 | Limicola falcinellus | Грязовик | | 3 | Limicola falcinellus |
| 60 | Gallinago solitaria | Горный дупель (бекас-отшельник) | | 4 | Gallinago solitaria |
| 61 | Gallinago media | Дупель | | 4 | Gallinago media |
| 62 | Numenius minutus | Малый кроншнеп (Кроншнеп-малютка) | | 4 | Numenius minutus |
| 63 | Numenius arquata | Большой кроншнеп | | 4 | Numenius arquata |
| 64 | Numenius madagascariensis | Дальневосточный кроншнеп | | 4 | Numenius madagascariensis |
| 65 | Limosa limosa | Большой веретенник | | 3 | Limosa limosa |
| 66 | Limnodromus semipalmatus | Азиатский бекасовидный веретенник | | 7 | Limnodromus semipalmatus |
| Ciconiiformes (Аистообразные) |
| Ciconiidae (Аистовые) |
| 7 | Ciconia nigra | Черный аист | | 3 | Ciconia nigra |
| Ardeidae (Цаплевые) |
| 5 | Botaurus stellaris | Большая выпь | | 4 | Botaurus stellaris |
| Threskiornithidae (Ибисовые) |
| 6 | Platalea leucorodia | Колпица | | 7 | Platalea leucorodia |
| Coraciiformes (Ракшеобразные) |
| Alcedinidae (Зимородковые) |
| 79 | Alcedo atthis | Обыкновенный зимородок | | 4 | Alcedo atthis |
| Falconiformes (Соколообразные) |
| Accipitridae (Ястребиные) |
| 22 | Pandion haliaetus | Скопа | | 3 | Pandion haliaetus |
| 23 | Pernis ptilorhyncus | Хохлатый осоед | | 4 | Pernis ptilorhynchus |
| 24 | Circus macrourus | Степной лунь | | 4 | Circus macrourus |
| 25 | Circus pygargus | Луговой лунь | | 4 | Circus pygargus |
| 26 | Hieraaetus pennatus | Орел-карлик | | 4 | Hieraaetus pennatus |
| 27 | Aquila rapax | Степной орел | | 4 | Aquila rapax |
| 28 | Aquila clanga | Большой подорлик | | 2 | Aquila clanga |
| 29 | Aquila heliaca | Могильник | | 3 | Aquila heliaca |
| 30 | Aquila chrysaetos | Беркут | | 4 | Aquila chrysaetos |
| 31 | Haliaeetus albicilla | Орлан белохвост | | 3 | Haliaeetus albicilla |
| 32 | Aegypius monachus | Черный гриф | | 7 | Aegypius monachus |
| 33 | Gypaetus barbatus | Бородач | | 7 | Gypaetus barbatus |
| Falconidae (Соколиные) |
| 34 | Falco rusticolus | Кречет | | 3 | Falco rusticolus |
| 35 | Falco cherrug milvipes | Балобан | | 3 | Falco cherrug milvipes |
| 35 | Falco cherrug cherrug | Балобан (подвид балобан обыкновенный) | | 1 | Falco cherrug cherrug |
| 36 | Falco peregrinus | Сапсан | | 4 | Falco peregrinus |
| 37 | Falco vespertinus | Кобчик | | 2 | Falco vespertinus |
| 38 | Falco naumanni | Степная пустельга | | 4 | Falco naumanni |
| Galliformes (Курообразные) |
| Phasianidae (Фазановые) |
| 39 | Tetraogallus altaicus | Алтайский улар | | 4 | Tetraogallus altaicus |
| Gaviiformes (Гагарообразные) |
| Gaviidae (Гагаровые) |
| 1 | Gavia adamsil | Белоклювая гагара | | 4 | Gavia adamsii |
| Gruiformes (Журавлеобразные) |
| Gruidae (Журавлиные) |
| 40 | Grus grus | Серый журавль | | 4 | Grus grus |
| 41 | Grus monacha | Черный журавль | | 4 | Grus monacha |
| 42 | Anthropoides virgo | Красавка | | 5 | Anthropoides virgo |
| Otididae (Дрофиные) |
| 46 | Otis tarda | Дрофа | | 7 | Otis tarda |
| Rallidae (Пастушковые) |
| 43 | Rallus aquaticus | Пастушок | | 4 | Rallus aquaticus |
| 44 | Porzana pusilla | Погоныш-крошка | | 4 | Porzana pusilla |
| 45 | Gallinula chloropus | Камышница | | 4 | Gallinula chloropus |
| Passeriformes (Воробьинообразные) |
| Remizidae (Ремезовые) |
| 88 | Remiz pendulinus | Обыкновенный ремез | | 4 | Remiz pendulinus |
| Alaudidae (Жаворонковые) |
| 80 | Calandrella cinerea | Жаворонок малый | | 4 | Calandrella cinerea |
| Emberizidae (Овсянковые) |
| 89 | Emberiza pallasi pallasi | Полярная южная овсянка | | 4 | Emberiza pallasi pallasi |
| Laniidae (Сорокопутовые) |
| 81 | Lanius excubitor | Серый сорокопут | | 4 | Lanius excubitor |
| Muscicapidae (Мухоловковые) |
| 85 | Phoenicurus auroreus | Сибирская горихвостка | | 3 | Phoenicurus auroreus |
| 86 | Phoenicurus erythrogaster | Краснобрюхая горихвостка | | 3 | Phoenicurus erythrogastrus |
| Timaliidae (Тимелиевые) |
| 87 | Panurus biarmicus | Усатая синица | | 3 | Panurus biarmicus |
| Prunellidae (Завирушковые) |
| 82 | Prunella collaris | Альпийская завирушка | | 3 | Prunella collaris |
| 83 | Prunella atrogularis | Черногорлая завирушка | | 3 | Prunella atrogularis |
| Sylviidae (Славковые) |
| 84 | Bradypterus tacsanowskius | Сибирская пестрогрудка | | 3 | Bradypterus tacsanowskius |
| Phoenicopteriformes (Фламингообразные) |
| Phoenicopteridae (Фламинговые) |
| 8 | Phoenicopterus roseus | Обыкновенный фламинго | | 7 | Phoenicopterus roseus |
| Podicipediformes (Поганкообразные) |
| Podicipedidae (Поганковые) |
| 2 | Podiceps ruficollis | Малая поганка | | 3 | Tachybaptus ruficollis |
| 3 | Podiceps nigricollis | Черношейная поганка | | 3 | Podiceps nigricollis |
| 4 | Podiceps auritus | Красношейная поганка | | 4 | Podiceps auritus |
| Strigiformes (Совообразные) |
| Strigidae (Настоящие совы) |
| 75 | Bubo bubo | Филин | | 3 | Bubo bubo |
| 76 | Otus scops | Сплюшка, Совка Сплюшка | | 4 | Otus scops |
| 77 | Glaucidium passerinum | Воробьиный сыч (сычик) | | 4 | Glaucidium passerinum |
| Columbiformes (Голубеобразные) |
| Columbidae (Голубиные) |
| 74 | Columba palumbus | Вяхирь | | 4 | Columba palumbus |
| Mammalia (Млекопитающие) |
| Artiodactyla (Парнопалые) |
| Bovidae |
| 23 | Capra sibirica | Козёл сибирский | Крыжинская субпопуляция (Курагинский район); Кашурниковская субпопуляция (Каратузский и Курагинский районы) | 0 | Capra sibirica |
| 24 | Ovis ammon | Архар | | 0 | Ovis ammon |
| 25 | Ovis nivicola borealis | Снежный баран, путоранский подвид | | 3 | Ovis nivicola borealis |
| Cervidae (Оленьи) |
| 19 | Cervus elaphus sibiricus | Марал | Аргинская субпопуляция (Боготольский и Ачинский районы) | 1 | Cervus elaphus sibiricus |
| 20 | Capreolus pygargus | Косуля сибирская | Бузимо-кантатско-кемская субпопуляция (Сухобузимский, Емельяновский и левобережные части Казачинского и Большемуртинского районов); Улуйско-боготольско-ачинская субпопуляция (Тюхтетский, Боготольский, Большеулуйский и Ачинский районы) | 2 | Capreolus pygargus |
| 21 | Rangifer tarandus valentinae | Сибирский лесной северный олень | Ангарская субпопуляция (Мотыгинский, Богучанский и Кежемский районы); Алтае-саянская субпопуляция (Ермаковский, Ирбейский, Каратузский, Курагинский, Партизанский, Саянский и Шушенский районы) | 2 | Rangifer tarandus valentinae |
| 22 | Alces alces pfizenmayeri | Лось | Ужуро-кузнецко-ачинская субпопуляция (Ужурский, Назаровский, Ачинский, Шарыповский и Боготольский районы); Солгонская субпопуляция (Ужурский, Назаровский и левобережная часть Балахтинского района) | 3; 2 | Alces alces pfizenmayeri |
| Carnivora (Хищные) |
| Odobenidae (Моржовые) |
| 15 | Odobenus rosmarus laptevi | Морж | | 3 | Odobenus rosmarus laptevi |
| 16 | Odobenus rosmarus rosmarus | Атлантический морж | | 2 | Odobenus rosmarus rosmarus |
| Canidae (Псовые) |
| 9 | Cuon alpinus | Красный волк | | 0 | Cuon alpinus |
| Felidae (Кошачьи) |
| 11 | Felis manul | Манул, палласов кот | | 3 | Felis manul |
| 12 | Uncia uncia | Ирбис, снежный барс | | 3 | Uncia uncia |
| Ursidae (Медвежьи) |
| 10 | Ursus maritimus | Белый медведь | | 3 | Ursus maritimus |
| Chiroptera (Рукокрылые) |
| Vespertilionidae (Гладконосые (обыкновенные) летучие мыши) |
| 1 | Myotis frater | Ночница длиннохвостая | | 3 | Myotis frater |
| 2 | Myotis ikonnikovi | Ночница Иконникова | | 4 | Myotis ikonnikovi |
| 3 | Myotis petax | Восточная ночница | | 4 | Myotis petax |
| 4 | Myotis dasycneme | Ночница прудовая | | 4 | Myotis dasycneme |
| 5 | Nyctalus noctula | Вечерница рыжая | | 3 | Nyctalus noctula |
| 6 | Eptesicus nilssonii | Северный кожан | | 4 | Eptesicus nilssonii |
| 7 | Vespertilio murinus | Кожан двухцветный | | 3 | Vespertilio murinus |
| 8 | Murina hilgendorfi | Сибирский трубконос | | 3 | Murina hilgendorfi |
| Rodentia (Грызуны) |
| Cricetidae (Хомяковые) |
| 14 | Alticola tuvinicus | Полёвка тувинская | | 2 | Alticola tuvinicus |
| Dipodidae (Тушканчиковые) |
| 13 | Sicista subtilis | Мышовка степная | | 4 | Sicista subtilis |
| Cetacea (Китообразные) |
| Monodontidae (Нарваловые) |
| 17 | Monodon monoceros | Нарвал | | 3 | Monodon monoceros |
| Balaenopteridae (Полосатиковые) |
| 18 | Balanoptera physalus physalus | Северный финвал (сельдяной кит) | | 2 | Balaenoptera physalus physalus |
| Reptilia (Рептилии) |
| Squamata (Чешуйчатые) |
| Colubridae (Ужовые) |
| 1 | Elaphe dione | Узорчатый полоз | | 4 | Elaphe dione |
Все ООПТ
